Le microbiote intestinal désigne l'ensemble des micro-organismes qui vivent dans notre tube digestif. Il joue un rôle actif dans la digestion des fibres, forme une barrière contre les micro-organismes indésirables et interagit en permanence avec le système immunitaire. Son équilibre, propre à chaque individu, peut être influencé par différents facteurs comme l'alimentation, le stress, le sommeil ou l'activité physique.
Bien plus qu’un simple organe digestif, l’intestin abrite un véritable écosystème de milliards de micro-organismes : le microbiote intestinal.
De quoi parle-t-on précisément ? Quelles sont ses grandes fonctions ? Et quels facteurs peuvent venir perturber son équilibre ? BioGaia® fait le point !
Qu'est-ce que le microbiote intestinal ?
Le microbiote intestinal correspond à l'ensemble des micro-organismes, essentiellement des bactéries, mais aussi des virus et des champignons, qui vivent dans notre intestin. Selon l'Inserm (2024), il en réunit environ 10 000 milliards. Cette communauté évolue en permanence, sous l'influence du mode de vie de chacun.
Une communauté vivante et propre à chacun
Chaque microbiote intestinal humain est unique : un peu comme une empreinte microbienne, deux personnes ne partagent jamais la même combinaison d'espèces bactériennes. Chaque espèce joue un rôle au sein de cet écosystème : c’est avant tout l’équilibre entre les différentes populations de micro-organismes qui contribue à l’équilibre du microbiote intestinal.
Quelle différence avec le microbiome ?
Selon l'Inserm, le microbiote ne doit pas être confondu avec le microbiome, un ensemble plus large qui englobe aussi les gènes et les activités biologiques de ces micro-organismes.
En quoi la diversité bactérienne est-elle importante ?
Ce n'est pas tant la quantité de bactéries qui importe, mais bien la diversité bactérienne. Un microbiote riche en espèces différentes assure plusieurs fonctions à la fois : digestion de fibres variées, production de vitamines, limitation de la place pour des bactéries indésirables... À l'inverse, un microbiote appauvri devient plus instable face aux potentielles perturbations.
« Chaque famille de bactéries se nourrit de fibres et de composés différents. Si votre alimentation est monotone, vous affamez certaines populations bactériennes. »
— Dr Julien Scanzi, gastro-entérologue, dans une vidéo pédagogique BioGaia®.
Quels sont les rôles du microbiote intestinal ?
Le microbiote intestinal remplit trois grandes fonctions : il participe à la digestion, forme une barrière protectrice face aux micro-organismes extérieurs et dialogue en permanence avec le système immunitaire.
Un rôle actif dans la digestion des fibres
Le microbiote intestinal digère les fibres alimentaires que les organes digestifs n’ont pas pu dégrader. Une fois dans le côlon, ces fibres sont fermentées par les bactéries, notamment les Firmicutes et les Bacteroidetes.
Selon l'Institut Pasteur, cette fermentation produit des acides gras à chaîne courte (AGCC), qui nourrissent les cellules de la paroi intestinale.
« Certaines de ces bactéries, comme les bifidobactéries et les lactobacilles, fermentent les fibres que nous ne digérons pas, et produisent des substances utiles à notre organisme. »
— Dr Julien Scanzi, gastro-entérologue, dans une vidéo pédagogique BioGaia®.
Un effet de barrière face aux micro-organismes indésirables
Le microbiote intestinal limite le développement de micro-organismes extérieurs en consommant les nutriments dont ces derniers auraient besoin pour se développer et en occupant l'espace disponible. Des bactéries bénéfiques, comme les Lactobacilles et les Bifidobactéries, contribuent particulièrement à cet effet de barrière en produisant des substances qui freinent leur croissance.
Une interaction constante avec le système immunitaire
Le lien entre microbiote et immunité est bien documenté : selon l'Inserm (2024), 70 à 80 % des cellules immunitaires se situent à proximité de la muqueuse intestinale. Ce voisinage permanent entraîne le système immunitaire à faire la différence entre les éléments inoffensifs, comme les aliments ou les bactéries naturellement présentes dans l'intestin, et les agents pathogènes potentiellement dangereux.
Quand parle-t-on de déséquilibre du microbiote ?
Selon l'Inserm, on parle de déséquilibre, ou dysbiose, lorsque la composition ou les fonctions du microbiote intestinal sont perturbées par rapport à son état d'équilibre, appelé eubiose. Ce basculement n'est pas figé : le microbiote peut retrouver son équilibre lorsque la perturbation s’atténue.
De l'eubiose à la dysbiose
Un microbiote en eubiose est stable : les espèces bactériennes y coexistent en proportions équilibrées. La dysbiose, à l'inverse, correspond à une rupture de cet équilibre : certaines populations diminuent, d'autres prolifèrent.
Quels facteurs peuvent perturber l’équilibre du microbiote ?
Plusieurs habitudes du quotidien peuvent influencer l'équilibre du microbiote intestinal :
- Une alimentation pauvre en fibres ou riche en produits ultra-transformés, qui prive les bactéries bénéfiques de leur principale source d'énergie ;
- La prise d'antibiotiques, qui en plus de s’attaquer aux bactéries ciblées, peut réduire temporairement des populations bactériennes utiles ;
- Le stress chronique, qui augmente le taux de cortisol : cette hormone peut fragiliser la paroi intestinale et la rendre plus perméable à des substances indésirables ;
- La sédentarité, qui réduit la production d’acides gras à chaîne courte (AGCC), des molécules qui nourrissent et protègent la paroi intestinale.
Quelles sont les conséquences d’un déséquilibre ?
Un déséquilibre du microbiote peut se traduire par une digestion moins efficace et un affaiblissement de l’effet de barrière intestinale, avec parfois des ballonnements, des inconforts après les repas ou des troubles du transit.
« Votre microbiote n'est pas figé. Il peut évoluer tout au long de votre vie, parfois très rapidement. Ce que vous mangez, certains médicaments comme les antibiotiques, une infection digestive ou même un voyage peuvent modifier sa composition. »
— Dr Julien Scanzi, gastro-entérologue, dans une vidéo pédagogique BioGaia®.
Comment soutenir son microbiote intestinal au quotidien ?
Quelques habitudes simples permettent de soutenir l'équilibre du microbiote intestinal au quotidien. Adopter une alimentation diversifiée et riche en fibres, associée à de bonnes habitudes de vie et, selon les besoins, à un apport en probiotiques, reste le meilleur moyen d'améliorer son microbiote progressivement.
Miser sur la diversité alimentaire et les fibres
Les fibres alimentaires jouent un rôle central dans l'équilibre du microbiote intestinal. On les retrouve dans les fruits, les légumes, les légumineuses et les céréales complètes. Certaines fibres, non digérées par notre organisme, sont utilisées par les bactéries intestinales. Associées à une alimentation variée, elles renforcent la diversité du microbiote intestinal.
Adopter des habitudes de vie favorables
Un sommeil de qualité et une activité physique régulière contribuent à maintenir un environnement intestinal stable. L’activité physique stimule notamment la motilité intestinale, c’est-à-dire les mouvements qui font progresser les aliments dans le tube digestif, ainsi que la production d’acides gras à chaîne courte. La régularité de ces habitudes est plus importante que leur intensité.
Penser aux prébiotiques, probiotiques et / ou postbiotiques
Selon l'ISAPP (International Scientific Association for Probiotics and Prebiotics), la différence entre probiotiques, prébiotiques et postbiotiques relève des définitions suivantes :
- Les prébiotiques sont des fibres qui nourrissent sélectivement les bactéries bénéfiques ;
- Les probiotiques* sont des micro-organismes vivants qui, en quantité suffisante, peuvent contribuer à l'équilibre du microbiote ;
- Les postbiotiques sont les substances qui sont produites par l'activité des bactéries bénéfiques.
« Deux probiotiques contenant des lactobacilles peuvent avoir des effets complètement différents si leurs souches sont différentes. »
— Dr Julien Scanzi, gastro-entérologue, dans une vidéo pédagogique BioGaia®.
Conclusion
Le microbiote intestinal est un écosystème vivant et propre à chacun, indispensable au bon fonctionnement de l'organisme. Il participe à la digestion, protège contre les micro-organismes indésirables et interagit avec le système immunitaire. Son équilibre peut être influencé par différents facteurs, notamment l'alimentation, le stress et les habitudes de vie. Adopter une alimentation variée, pratiquer une activité physique régulière et veiller à la qualité de son sommeil sont autant de bonnes habitudes à privilégier.
Sources
- Inserm (Institut national de la santé et de la recherche médicale) : Dossier d'information - Microbiote intestinal https://www.inserm.fr/dossier/microbiote-intestinal-flore-intestinale/
- Institut Pasteur : Microbiote intestinal, un écosystème d'une richesse inouïe https://www.pasteur.fr/fr/journal-recherche/actualites/microbiote-intestinal-ecosysteme-richesse-inouie
- Fondation pour la Recherche Médicale : Tout savoir sur le microbiote intestinal https://www.frm.org/fr/maladies/recherches-autres-maladies/microbiote-intestinal/focus-microbiote-intestinal
- ISAPP (International Scientific Association for Probiotics and Prebiotics) : Consensus statement on the definition and scope of postbiotics https://isappscience.org/resource/expert-consensus-document-the-international-scientific-association-for-probiotics-and-prebiotics-isapp-consensus-statement-on-the-definition-and-scope-of-postbiotics/
- BioGaia International, Gut Health Resources https://fr.biogaia.com
- Dr Julien Scanzi, vidéos et interventions pédagogiques BioGaia®
* Les probiotiques participent à l'équilibre du microbiote intestinal.
Les compléments alimentaires doivent être utilisés dans le cadre d'un mode de vie sain et ne pas être utilisés comme substituts d'un régime alimentaire varié et équilibré.
Ne pas dépasser la dose journalière recommandée.
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Pour votre santé, mangez au moins cinq fruits et légumes par jour.